وواجهت النيابة خلال التحقيقات «الفخراني» بما هو منسوب إليه من قيامه بالتحريض على أحداث العنف التي اندلعت في الذكرى الثانية لثورة 25 يناير في مدينة المحلة، وما سمته «تحريضه على التعدي على مجلس مدينة المحلة، وإتلاف ما به من محتويات وحرقه، من خلال إمداده بعض المتهمين مرتكبي تلك الجرائم بالأموال والمساعدة والاتفاق على ارتكاب تلك الجرائم».