انتقد المجلس القومي لحقوق الإنسان تصاعد ظاهرة استخدام الدين والشعارات الدينية لمحاولة التأثير على الناخبين،كذلك زيادة حالات منع بعض المراقبين من ممارسة مهامهم فى متابعة مراحل العملية الانتخابية.
وذكر التقرير أن عدد الشكاوى المتلقاة خلال تلك المرحلتين الأولى والثانية من الانتخابات بلغ 660 شكوى، مشيرا إلى أن النسبة الأعلى للشكاوى جاءت بالمرحلة الأولى من محافظات سوهاج، والبحيرة، وبنى سوبف.