شارك مركز بحوث الصحراء في معرض القاهرة الرابع للابتكار، والذي قامت بتنظيمه أكاديمية البحث العلمي والتكنولوجيا، ونجح المركز في الحصول على ثلاث جوائز للابتكار في المعرض.
وفاز مركز التميز المصري لأبحاث تحلية المياه التابع لمركز بحوث الصحراء، بجائزتين في التحالف القومي للمعرفة والتكنولوجيا في مجال تحلية المياه، وكذلك جائزة لتصميم وتنفيذ محطة تحلية مياه بحر متنقلة، تعمل بالطاقة الشمسية من أجل التنمية المستدامة بالشلاتين.
كما حصل مركز بحوث الصحراء، ممثلا في مكتب تسويق ونقل التكنولوجيا(TICO) على المركز الأول على مستوى مكاتب نقل التكنولوجيا على المستوى القومي.