قام جهاز شؤون البيئة من خلال الإدارة المركزية للسواحل والبحيرات بالمشاركة في تنفيذ مشروع «محور تنمية البحيرات الشمالية وبحيرة قارون»، الذي تعده وزارة الموارد المائية والرى (الهيئة المصرية العامة لحماية الشواطئ) بالتعاون مع عدد من الجهات المعنية بادارة وتنمية البحيرات المصرية.
يهدف المشروع إلى تقديم دراسة متكاملة للوضع البيئى والاجتماعى والاقتصادى للبحيرات الشمالية وبحيرة قارون للتعرف على أهم المشاكل البيئية، التي تتعرض لها تلك البحيرات، وذلك في إطار بروتوكول التعاون الخاص «بإعادة تأهيل البحيرات الشمالية» الموقع بين وزارت البيئة، الزراعة واستصلاح الأراضي، وزارة الموارد المائية والري، وزارة الدولة للبحث العلمي.
ويتم تنفيذ المشروع بمشاركة عدة جهات منها وزارة الرى والموارد المائية، الهيئة المصرية العامة لحماية الشواطئ، ديوان عام محافظات كلاً من (كفر الشيخ/ البحيرة/ الإسكندرية)، شرطة البيئة والمسطحات المائية، معهد بحوث الهيدروليكا، معهد بحوث الشواطئ، والهيئة العامة لتنمية الثروة السمكية.